El territorio del Cusco percibe la influencia del macro-clima producida por las grandes masas de aire provenientes de la selva sur, fuera de las regiones alto andinas, e incluso de la región distante de la Patagonia. Los vientos fuera de la selva sur traen grandes masas de humedad, sopladas por los vientos alisios del este.

Los vientos que vienen de las zonas alto andinas de Perú y Bolivia son fríos y secos, como aquellas que vienen de la Patagonia, y estos generalmente suponen eventos climáticos a grandes escalas. Estos vienen del sudeste.

Mientras que por otro lado, los vientos locales que ingresan a los valles y llanuras del Cusco sirven para distribuir calor y humedad durante el día.

Existen dos periodos climáticos: le época de lluvias, de noviembre hasta marzo y la época de secas, de abril a octubre.

Clima cálido (húmedo y seco))
Humedad: Áreas de la selva baja, como en el norte de Urubamba y la parte este del departamento a la entrada a Pillcopata y los valles de Araza.

Precipitación: Mayor a 1,000 mm al año.

Temperaturas:

• Máxima: alrededor de 30°
• Media: entre 23°° y 25°
• Mínima: alrededor de 20°

Seco:
Los climas secos y cálidos se encuentran en las regiones bajas de los yungas, los cuales aparecen, en forma de un cañón, en la orilla del río Apurimac, en el centro y al sur del departamento.
Precipitacion: Menor a 500 mm al año.

Temperaturas:

• Máxima: a 32°
• Media: entre 17° y 18°
• Mínima: a 4.4°

Templado (húmedo y seco)
Los climas en los valles de la zona central del territorio del Cusco, donde la diferencia en humedad está marcada por la localización en la altura. La proximidad del este implica mayor humedad, mientras que la proximidad del oeste implica más sequedad. Las zonas de clima templado son de vital importancia para el establecimiento de la población.

Temperaturas:

• Máxima: a 29°°
• Media: entre 11° y 16°
• Mínima: entre 7° y -4°

Frío (húmedo y seco)
Encontrarás este clima especialmente en las zonas altas de los valles, en las punas y en las regiones rodeadas por los glaciares, así como también en áreas con una altitud mayor a 3,800 msnm.

Temperaturas:

• Máxima: a 10°
• Media: dependiendo de la altitud
• Mínima: menor a 0°