De regios van Cusco staan onder invloed van het makro-klimaat door de wind van het zuiden, de hooglanden en van de afgelegen regios van Patagonia. De wind van het zuiden zorgt voor vochtige lucht, de oosten wind.

De winden die komen vanaf de Peruaanse of Bolivaanse hooglanden zijn kouden en droger dan die vanaf Patagonie, en zorgen over het algemeen voor grotere klimaatveranderingen. Deze komen vanaf het zuiden.

Aan de andere kant, de lokale winden die door de vallei en vlaktes van Cusco waaien zorgen overdag voor meer warmte en humidity.

Er zijn twee perioden: het regenseizoen, van november tot en met maart en het droge seizoen van april tot en met oktober.

Warm klimaat (vochtig en droog)
Vochtigheid: de gebieden met lage begroeiing, zoals ten noorden van Urubamba en het oostelijk deel van dit departement, Pillcopata en Araza vallei.

Precipitation: meer dan 1.000 mm. Per jaar.

Temperatuur:

• Maximum: rond 30°
• Gemiddeld: tussen 23° en 25°
• Minimum: rond 20°

Droog:
Het warme en droge klimaat bevindt zich in de lage yungas, die te voorschijn komen in de vorm van een canyon, bij rivier Apurimac, in het midden en het zuidoosten van het departement.
Precipitation: minder dan 500 mm. Per jaar.

Temperatuur:

• Maximum: tot 32°
• Gemiddeld: tussen 17° en 18°
• Minimum: tot 4.4°

Gemiddeld (vochtig en droog)
De klimaten in de vallei en in het centrale gebied van Cusco zijn de verschillen in vochtigheid gerelateerd aan de hellingen. De nabijheid van het oosten impliceert meer vochtigheid, terwijl de nabijheid van het westen meer droogte impliceert. De gebieden van gematigde klimaten zijn van essentieel belang voor de totstandbrenging van de bevolking.

Temperatuur:

• Maximum: tot 29°
• Median: tussen 11° en 16°
• Minimum: tussen 7° en -4°

Koud (vochtig en droog)
Je vindt dit klimaat vooral op het hoge gebied van de valleien, in punas en in de gebieden die door gletsjers worden omringd, evenals op gebieden hoger dan 3.800m.

Temperatuur:

• Maximum: tot 10°
• Median: afhankelijk van de hoogte
• Minimum: beneden 0°